Ha sido reconocido como Patrimonio Natural de la Humanidad en 1987, y  en 1977, la Unesco lo reconoció como zona núcleo de la Reserva de Biósfera.Se ubica en los departamentos de Cusco y Madre de Dios.

El Parque Nacional del Manú tiene una superficie de 1 716 295,22 hectáreas y representa parte de la gran diversidad biológica que existe en la Amazonía.

Debido a la variación altitudinal, desde los 200 hasta casi los 4 metros sobre el nivel del mar, posee casi todas las formaciones ecológicas subtropicales del oriente peruano. En esta inmensa superficie existen especies y ecosistemas de gran interés científico.

En la cercanía de los ríos se encuentran árboles característicos, como el cetico (Cecropia sp.) y la topa (Ochroma sp). También se encuentran árboles como el cedro (Cedrela sp.), el tornillo (Cedrelinga catenaeformis), la castaña (Bertholletia excelsa), la lupuna (Chorisia sp.) y el jebe (Hevea brasiliensis), entre otros, formando mosaicos de bosque húmedo tropical.

En este parque se protege una gran variedad de especies animales: más de 800 especies de aves y 200 de mamíferos (entre los que se encuentran más de 100 especies de murciélagos). Existen más de 120 especies de peces y los reptiles son también abundantes y variados, al igual que los insectos y otros invertebrados que sobrepasan el millón de especies. En esta región es posible observar aves muy difíciles de encontrar en otros lugares de la selva como el águila harpía (Harpia harpyja), el jabirú (Jabiru mycteria) y el espátula rosada (Ajaia ajaja).  

En las orillas de los ríos, sobre las ramas de los árboles, se encuentra el sacha pato (Cairina moschata), ancestro silvestre del pato criollo. Además existen especies de fauna silvestre como son el ganso selvático o ganso del Orinoco (Neochen jubata), el gallito de las rocas (Rupicola peruviana), el mono choro común (Lagothrix lagotricha), el maquisapa negro (Ateles paniscus), el lobo de río (Pteronura brasiliensis), el jaguar (Panthera onça), el tigrillo (Leopardus pardalis), el oso de anteojos (Tremarctos ornatus) y la taruca (Hippocamelus antisensis).

En esta zona, no sólo la fauna y flora o sus bellos paisajes son de interés. En sus inmediaciones viven poblaciones agrupadas en más de 30 comunidades campesinas que mantienen el quechua como su lengua materna. También hay poblaciones nativas amazónicas pertenecientes a diferentes grupos lingüísticos que han ocupado la zona ancestralmente, como son las etnias Matsiguenka, Amahuaca, Yine, Amarakaeri, Huachipaire, Mashco-Piros y Nahua.

Además, existen restos arqueológicos aún no estudiados, así como otros muy conocidos, como son los Petroglifos de Pusharo, en la región del río Palotoa y las Ruinas de Mameria.

Entre los objetivos de creación del Parque Nacional está el conservar una muestra representativa de la diversidad biológica de la selva tropical del sudeste del Perú, para así contribuir al desarrollo regional mediante la investigación y el monitoreo de los parámetros ambientales.

Asimismo, se busca desarrollar programas antropológicos relacionados con las comunidades asentadas en el parque.