En la cuenca alta del río Cañete confluyen excepcionalmente todos los elementos necesarios para la conservación y uso sostenible de recursos hídricos y paisajísticos.

En esta zona se encuentra un interesante sistema de humedales altoandinos, entre los que destacan las lagunas de Paucarcocha, Moyococha, Huascacocha y Yatama. También se pueden observar manchales de queñual (Polylepis sp.), género endémico de la región andina que está protegido por el estado peruano, así como Cactáceas y Poáceas altoandinas.

Esta Zona Reservada protege muestras representativas de los Andes Meridionales Subtropicales en el Perú, que incluyen el páramo húmedo subalpino Tropical, la estepa montano Tropical y el nival Tropical.

Los principales objetivos de la Zona Reservada Alto Cañete y Cochas-Pachacayo son mantener la disponibilidad de agua de buena calidad para la población y para el desarrollo de actividades económicas en la cuenca del río Cañete; proteger el sistema de lagunas altoandinas que existen en la zona, por ser hábitat para la vida silvestre nativa y migratoria.

También recuperar hábitats degradados para sustentar la conservación de la diversidad biológica local y convertir la zona en un atractivo turístico donde se favorezca la práctica de actividades ecoturísticas y deportes de aventura; y promover el desarrollo de actividades de uso sostenible de recursos naturales.